Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms