Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms