Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms