Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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