Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd1A2AKB4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms