Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Kiaa1109A2AAE1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms