Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Krtap1-3A2A588 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms