Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hdac6Q9Z2V5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac6Q9Z2V5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hdac6Q9Z2V5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdac6Q9Z2V5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms