Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms