Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3Q9Z2D8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms