Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trip6Q9Z1Y4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms