Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Clip2Q9Z0H8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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