Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms