Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn4Q9WU22 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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