Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Psma1Q9R1P4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms