Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsjQ9R014 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsjQ9R014 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsjQ9R014 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms