Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn8Q9QZ49 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms