Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms