Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc5Q9QX29 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms