Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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