Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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