Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Rabgef1Q9JM13 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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