Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col5a3Q9JLI2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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