Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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