Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl39Q9JKF7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms