Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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