Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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