Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms