Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms