Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r63Q9EPT1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r63Q9EPT1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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