Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnft1Q9DCN7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms