Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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