Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms