Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pop5Q9DB28 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms