Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc89Q9DA73 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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