Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift43Q9DA69 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift43Q9DA69 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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