Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KnstrnQ9D9Z1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms