Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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