Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp5Q9D7S9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms