Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cul5Q9D5V5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cul5Q9D5V5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cul5Q9D5V5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cul5Q9D5V5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cul5Q9D5V5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cul5Q9D5V5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul5Q9D5V5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms