Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrameQ9D4Z5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms