Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al3Q9D4U4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms