Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms