Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trappc6bQ9D289 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trappc6bQ9D289 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trappc6bQ9D289 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms