Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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