Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms