Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mms19Q9D071 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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