Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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