Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Tdrd12Q9CWU0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Tdrd12Q9CWU0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Tdrd12Q9CWU0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Tdrd12Q9CWU0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tdrd12Q9CWU0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Tdrd12Q9CWU0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Tdrd12Q9CWU0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Tdrd12Q9CWU0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tdrd12Q9CWU0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tdrd12Q9CWU0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tdrd12Q9CWU0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tdrd12Q9CWU0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tdrd12Q9CWU0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd12Q9CWU0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms