Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms